Existen muchas diferencias en las regulaciones fitosanitarias de países como Nueva Zelanda y Australia, con regulaciones fitosanitarias muy estrictas, comparado con el sistema fitosanitario común establecido en Europa que mantiene una autorización general para las importaciones en su conjunto.

Las características particulares de las regiones insulares participantes en el proyecto, las exponen dentro de este marco común a riesgos de entrada de organismos nocivos que no se dan en el continente.

El proyecto CUARENTAGRI pretende implementar el sistema de protección fitosanitaria de las regiones ultraperiféricas europeas participantes y contribuir a la mejora en otras regiones participantes.